Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PRAC1Q96KF2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms