Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A4AQ96JQ5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms