Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF183Q96D59 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF183Q96D59 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF183Q96D59 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF183Q96D59 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF183Q96D59 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RNF183Q96D59 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF183Q96D59 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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RNF183Q96D59 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RNF183Q96D59 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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RNF183Q96D59 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RNF183Q96D59 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RNF183Q96D59 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RNF183Q96D59 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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