Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIFAP3Q92845 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms