Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRQ92752 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRQ92752 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRQ92752 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRQ92752 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRQ92752 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRQ92752 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNRQ92752 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNRQ92752 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TNRQ92752 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNRQ92752 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNRQ92752 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNRQ92752 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNRQ92752 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNRQ92752 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNRQ92752 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNRQ92752 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNRQ92752 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNRQ92752 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNRQ92752 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRQ92752 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRQ92752 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRQ92752 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRQ92752 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRQ92752 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRQ92752 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNRQ92752 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRQ92752 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRQ92752 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRQ92752 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRQ92752 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRQ92752 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRQ92752 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRQ92752 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNRQ92752 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRQ92752 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNRQ92752 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms