Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms