Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC9Q8TBE3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms