Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms