Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z494

NPHP3, Nephrocystin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3Q7Z494 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP3Q7Z494 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP3Q7Z494 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms