Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC80Q76M96 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC80Q76M96 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms