Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf47Q6ZRZ4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms