Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms