Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms