Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNT1Q5JUK3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNT1Q5JUK3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms