Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF3Q3KNV8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms