Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM71Q2Q1W2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms