Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFX7Q2KHR2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms