Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM187BQ17R55 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM187BQ17R55 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms