Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME3Q16798 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME3Q16798 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME3Q16798 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME3Q16798 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME3Q16798 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME3Q16798 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME3Q16798 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME3Q16798 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ME3Q16798 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ME3Q16798 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME3Q16798 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME3Q16798 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME3Q16798 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ME3Q16798 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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