Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ASIC2Q16515 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms