Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HNF4GQ14541 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HNF4GQ14541 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HNF4GQ14541 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HNF4GQ14541 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HNF4GQ14541 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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