Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1CQ13936 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1CQ13936 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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