Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC1Q13547 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
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