Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPA4Q13156 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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