Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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CALCOCO2Q13137 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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CALCOCO2Q13137 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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CALCOCO2Q13137 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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CALCOCO2Q13137 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CALCOCO2Q13137 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CALCOCO2Q13137 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CALCOCO2Q13137 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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