Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRN3Q13033 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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