Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFCP2Q12800 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TFCP2Q12800 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms