Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 FAR11YNL127W 2862 nt2.68□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 CAT2YML042W 2013 nt2.68□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 ESL2YKR096W 3588 nt2.67□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 YJL022WYJL022W 309 nt2.67□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 RPS29AYLR388W 171 nt2.67□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 RPS17AYML024W 411 nt2.67□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 CDC53YDL132W 2448 nt2.67□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 RLM1YPL089C 2031 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 YDR341CYDR341C 1824 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 RPL31AYDL075W 342 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 BCK1YJL095W 4437 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 NCA2YPR155C 1851 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 FIG4YNL325C 2640 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 AXL1YPR122W 3627 nt2.66□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 NAM7YMR080C 2916 nt2.65□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 SLM1YIL105C 2061 nt2.65□□□□□ -1.98
YLL054CQ12244 EMP24YGL200C 612 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YHR217CYHR217C 462 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 MBB1YJL199C 327 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YOR102WYOR102W 351 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 TOF1YNL273W 3717 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 NOC3YLR002C 1992 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 TRA1YHR099W 11235 nt2.65□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 SKP2YNL311C 2292 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 ENV11YGR071C 2583 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 AHC1YOR023C 1701 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 HSH155YMR288W 2916 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 RAD34YDR314C 2079 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 RRP6YOR001W 2202 nt2.64□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 TRS130YMR218C 3309 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 INP53YOR109W 3324 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YPL044CYPL044C 549 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YDR186CYDR186C 2634 nt2.63□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 NEW1YPL226W 3591 nt2.62□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 SPF1YEL031W 3648 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 ZRG8YER033C 3231 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 ZRG17YNR039C 1818 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 HSL1YKL101W 4557 nt2.61□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 RPO41YFL036W 4056 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 CDC31YOR257W 486 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 MRD1YPR112C 2664 nt2.6□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 PMP2YEL017C-A 132 nt2.59□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.59□□□□□ -1.99
YLL054CQ12244 YPL150WYPL150W 2706 nt2.59□□□□□ -2
YLL054CQ12244 AIM44YPL158C 2277 nt2.58□□□□□ -2
YLL054CQ12244 SEC26YDR238C 2922 nt2.58□□□□□ -2
YLL054CQ12244 PAA1YDR071C 576 nt2.58□□□□□ -2
YLL054CQ12244 HOS4YIL112W 3252 nt2.58□□□□□ -2
YLL054CQ12244 ZIP2YGL249W 2115 nt2.57□□□□□ -2
YLL054CQ12244 NOP14YDL148C 2433 nt2.56□□□□□ -2
YLL054CQ12244 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt2.56□□□□□ -2
YLL054CQ12244 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.56□□□□□ -2
YLL054CQ12244 NUM1YDR150W 8247 nt2.56□□□□□ -2
YLL054CQ12244 MAD1YGL086W 2250 nt2.55□□□□□ -2
YLL054CQ12244 RSE1YML049C 4086 nt2.54□□□□□ -2
YLL054CQ12244 EDS1YBR033W 2760 nt2.54□□□□□ -2
YLL054CQ12244 TOR1YJR066W 7413 nt2.53□□□□□ -2
YLL054CQ12244 PIP2YOR363C 2991 nt2.53□□□□□ -2
YLL054CQ12244 BNI1YNL271C 5862 nt2.53□□□□□ -2
YLL054CQ12244 AMS1YGL156W 3252 nt2.53□□□□□ -2
YLL054CQ12244 IFH1YLR223C 3258 nt2.53□□□□□ -2
YLL054CQ12244 VTC3YPL019C 2508 nt2.52□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 UBR1YGR184C 5853 nt2.52□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 MMS22YLR320W 4365 nt2.52□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 APL2YKL135C 2181 nt2.52□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 YBR099CYBR099C 384 nt2.52□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 DNA2YHR164C 4569 nt2.52□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 RPS30BYOR182C 192 nt2.51□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 STH1YIL126W 4080 nt2.51□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 SLD3YGL113W 2007 nt2.51□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 FKS3YMR306W 5358 nt2.5□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.5□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 CTF4YPR135W 2784 nt2.5□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 IRA2YOL081W 9240 nt2.5□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.49□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.49□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.48□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 TIM9YEL020W-A 264 nt2.48□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 ZIP1YDR285W 2628 nt2.48□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 ARP8YOR141C 2646 nt2.48□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 RGA1YOR127W 3024 nt2.47□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 PHO91YNR013C 2685 nt2.47□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 SAS3YBL052C 2496 nt2.47□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 CSF1YLR087C 8877 nt2.47□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 PDR1YGL013C 3207 nt2.47□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.47□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 snR61snR61 90 nt2.47□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 YDR521WYDR521W 336 nt2.47□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 COX12YLR038C 252 nt2.47□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 YBR206WYBR206W 324 nt2.47□□□□□ -2.01
YLL054CQ12244 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.7 ms