Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YLR101CYLR101C 396 nt-0.36□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 INP2YMR163C 2118 nt-0.36□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 CUL3YGR003W 2235 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 ATP20YPR020W 348 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 RPM2YML091C 3609 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 CSM4YPL200W 471 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 YPR099CYPR099C 357 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 TDA2YER071C 381 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 VPS63YLR261C 327 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 BI4Q0120 1917 nt-0.39□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 EFR3YMR212C 2349 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 snR8snR8 190 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 BSC3YLR465C 309 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 MMS21YEL019C 804 nt-0.41□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 RAD61YDR014W 1944 nt-0.41□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 YJR011CYJR011C 786 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 YLR271WYLR271W 825 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 GSP1YLR293C 660 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 YBR064WYBR064W 429 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 COX5BYIL111W 456 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 YPL044CYPL044C 549 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 SOV1YMR066W 2697 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 SEC10YLR166C 2616 nt-0.43□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 YPL185WYPL185W 396 nt-0.43□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.43□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 ORC3YLL004W 1851 nt-0.43□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 YDR008CYDR008C 351 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 OLI1Q0130 231 nt-0.45□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 MAM33YIL070C 801 nt-0.45□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.46□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 snR79snR79 84 nt-0.47□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 HTB2YBL002W 396 nt-0.47□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 CDC33YOL139C 642 nt-0.47□□□□□ -2.48
TY1B-BRQ12193 snR57snR57 88 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 IRC2YDR112W 309 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 YDR210WYDR210W 228 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 POP6YGR030C 477 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 DFG10YIL049W 762 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 NPC2YDL046W 522 nt-0.48□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 RUB1YDR139C 234 nt-0.49□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.49□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 YPL197CYPL197C 414 nt-0.49□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 ASE1YOR058C 2658 nt-0.49□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.49□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 YOL160WYOL160W 342 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 HTB1YDR224C 396 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 LSO2YGR169C-A 279 nt-0.5□□□□□ -2.49
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TY1B-BRQ12193 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 DAD1YDR016C 285 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.51□□□□□ -2.49
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TY1B-BRQ12193 snR59snR59 78 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 ECM9YKR004C 1134 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 PAN3YKL025C 2040 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 YEL073CYEL073C 324 nt-0.53□□□□□ -2.49
TY1B-BRQ12193 EMC4YGL231C 573 nt-0.53□□□□□ -2.49
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TY1B-BRQ12193 RPS26AYGL189C 360 nt-0.54□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 YGL204CYGL204C 306 nt-0.54□□□□□ -2.5
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TY1B-BRQ12193 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 YBR206WYBR206W 324 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.56□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.56□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 RPS7BYNL096C 573 nt-0.56□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 UBS1YBR165W 834 nt-0.56□□□□□ -2.5
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TY1B-BRQ12193 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 YOL106WYOL106W 354 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 OST4YDL232W 111 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 LIN1YHR156C 1023 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 MRPL31YKL138C 396 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 RSM23YGL129C 1353 nt-0.58□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.58□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 YJL135WYJL135W 318 nt-0.58□□□□□ -2.5
TY1B-BRQ12193 GPX1YKL026C 504 nt-0.58□□□□□ -2.5
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TY1B-BRQ12193 snR33snR33 183 nt-0.6□□□□□ -2.51
TY1B-BRQ12193 NFU1YKL040C 771 nt-0.62□□□□□ -2.51
TY1B-BRQ12193 YNL146WYNL146W 303 nt-0.62□□□□□ -2.51
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