Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 BI3Q0115 1554 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1B-LR1Q12088 CMS1YLR003C 876 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-LR1Q12088 HTB2YBL002W 396 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-LR1Q12088 BSC3YLR465C 309 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-LR1Q12088 OLI1Q0130 231 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-LR1Q12088 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-LR1Q12088 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-LR1Q12088 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-LR1Q12088 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-LR1Q12088 YBR206WYBR206W 324 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-LR1Q12088 COX5BYIL111W 456 nt-0.53□□□□□ -2.49
TY1B-LR1Q12088 YDL152WYDL152W 366 nt-0.54□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YEL073CYEL073C 324 nt-0.54□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 EMC4YGL231C 573 nt-0.54□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 MAM33YIL070C 801 nt-0.54□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YDR290WYDR290W 330 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YGL042CYGL042C 306 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 snR128snR128 126 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YPL044CYPL044C 549 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 TDA2YER071C 381 nt-0.56□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YNR077CYNR077C 255 nt-0.56□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YBR064WYBR064W 429 nt-0.56□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 THG1YGR024C 714 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 ECM9YKR004C 1134 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 CDC33YOL139C 642 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YPL185WYPL185W 396 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 BI4Q0120 1917 nt-0.58□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.58□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 ATP20YPR020W 348 nt-0.59□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 RFX1YLR176C 2436 nt-0.59□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.6□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 HTB1YDR224C 396 nt-0.6□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 MMS21YEL019C 804 nt-0.6□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 RPL29YFR032C-A 180 nt-0.6□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.6□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 YPR099CYPR099C 357 nt-0.6□□□□□ -2.5
TY1B-LR1Q12088 ASE1YOR058C 2658 nt-0.6□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 snR24snR24 89 nt-0.6□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 ERV15YBR210W 429 nt-0.6□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 NIP1YMR309C 2439 nt-0.61□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 AI5_BETAQ0075 1065 nt-0.61□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 RSM18YER050C 417 nt-0.61□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 YLR271WYLR271W 825 nt-0.61□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 GSP1YLR293C 660 nt-0.61□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 YKU70YMR284W 1809 nt-0.62□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 DAD1YDR016C 285 nt-0.62□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 RPS7BYNL096C 573 nt-0.62□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 snR33snR33 183 nt-0.62□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 RPS26AYGL189C 360 nt-0.62□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.63□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.63□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.63□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 YDR008CYDR008C 351 nt-0.64□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.64□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 YDR344CYDR344C 444 nt-0.65□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 YGL204CYGL204C 306 nt-0.65□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 PET20YPL159C 762 nt-0.65□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 RUB1YDR139C 234 nt-0.65□□□□□ -2.51
TY1B-LR1Q12088 YOL118CYOL118C 309 nt-0.66□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 LSO2YGR169C-A 279 nt-0.67□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 RUF20RUF20 443 nt-0.67□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 YNL171CYNL171C 369 nt-0.67□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.67□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 PFS1YHR185C 714 nt-0.68□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 YJR079WYJR079W 330 nt-0.68□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.68□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 VPS63YLR261C 327 nt-0.68□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 RPS10BYMR230W 318 nt-0.68□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.69□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 snR79snR79 84 nt-0.7□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 OST4YDL232W 111 nt-0.7□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.7□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 TIM13YGR181W 318 nt-0.7□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 YOL160WYOL160W 342 nt-0.7□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 TFB6YOR352W 1032 nt-0.7□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 snR44snR44 211 nt-0.7□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 YJL120WYJL120W 324 nt-0.71□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.71□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 MCM10YIL150C 1716 nt-0.71□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 NFU1YKL040C 771 nt-0.72□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 GIM5YML094W 492 nt-0.72□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.72□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 YNL146WYNL146W 303 nt-0.72□□□□□ -2.52
TY1B-LR1Q12088 UBS1YBR165W 834 nt-0.73□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.74□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 PTP2YOR208W 2253 nt-0.75□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 PAN3YKL025C 2040 nt-0.75□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 DFG10YIL049W 762 nt-0.75□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 YPL205CYPL205C 345 nt-0.75□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.76□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 RSM23YGL129C 1353 nt-0.76□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 MRPL31YKL138C 396 nt-0.76□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 YCR022CYCR022C 345 nt-0.77□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 IRC2YDR112W 309 nt-0.77□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 YFR057WYFR057W 456 nt-0.77□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.77□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 snR36snR36 182 nt-0.77□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 YJL135WYJL135W 318 nt-0.78□□□□□ -2.53
TY1B-LR1Q12088 COY1YKL179C 2040 nt-0.78□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58 ms