Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 RSM22YKL155C 1887 nt1.34□□□□□ -2.19
SPE3Q12074 RPS24BYIL069C 408 nt1.33□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 YAR047CYAR047C 321 nt1.33□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.33□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 SWI4YER111C 3282 nt1.32□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 UPS1YLR193C 528 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 YPR063CYPR063C 423 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 PBY1YBR094W 2262 nt1.31□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 SCW11YGL028C 1629 nt1.3□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 SPT21YMR179W 2277 nt1.3□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 RAD9YDR217C 3930 nt1.3□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 YKL083WYKL083W 615 nt1.29□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 YLL020CYLL020C 306 nt1.29□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 HCH1YNL281W 462 nt1.29□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 YPL185WYPL185W 396 nt1.29□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 SIP4YJL089W 2490 nt1.29□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 MPT5YGL178W 2580 nt1.28□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 NUP188YML103C 4968 nt1.28□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.28□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.28□□□□□ -2.2
SPE3Q12074 PCF11YDR228C 1881 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YAP6YDR259C 1152 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 snR14snR14 160 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 NUP145YGL092W 3954 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 ZIP2YGL249W 2115 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 UTP20YBL004W 7482 nt1.27□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.26□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YOL159CYOL159C 516 nt1.26□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 RPB10YOR210W 213 nt1.26□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 RPL33BYOR234C 324 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 PRM3YPL192C 402 nt1.25□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 ALY2YJL084C 3141 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 NPC2YDL046W 522 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 CDC36YDL165W 576 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 AGA2YGL032C 264 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YJR157WYJR157W 363 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 RPL26AYLR344W 384 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 VPS20YMR077C 666 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 ISF1YMR081C 1017 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 RRT1YBL048W 312 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YOR029WYOR029W 336 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YBR012CYBR012C 420 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 SPT7YBR081C 3999 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 PAC1YOR269W 1485 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 APL3YBL037W 3078 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 SLI15YBR156C 2097 nt1.24□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YNL058CYNL058C 951 nt1.23□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YPL261CYPL261C 309 nt1.23□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 LCD1YDR499W 2244 nt1.22□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YLR434CYLR434C 384 nt1.22□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.22□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 snR51snR51 107 nt1.22□□□□□ -2.21
SPE3Q12074 MMS4YBR098W 2076 nt1.21□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YHL041WYHL041W 450 nt1.21□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YOL160WYOL160W 342 nt1.21□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.2□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YGR042WYGR042W 816 nt1.2□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 RPS30BYOR182C 192 nt1.2□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YJR003CYJR003C 1560 nt1.2□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 EAF1YDR359C 2949 nt1.19□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YJL135WYJL135W 318 nt1.19□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YOR199WYOR199W 330 nt1.19□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 ROM2YLR371W 4071 nt1.19□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 INP2YMR163C 2118 nt1.18□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.18□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 STB6YKL072W 2301 nt1.18□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 SET3YKR029C 2256 nt1.18□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 FIG4YNL325C 2640 nt1.18□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 snR72snR72 98 nt1.17□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YER079WYER079W 633 nt1.17□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.17□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 SWF1YDR126W 1011 nt1.16□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.16□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.16□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 PDE2YOR360C 1581 nt1.16□□□□□ -2.22
SPE3Q12074 ATG31YDR022C 591 nt1.15□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 YOR053WYOR053W 342 nt1.15□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 YBR285WYBR285W 435 nt1.15□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 NST1YNL091W 3723 nt1.15□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 STO1YMR125W 2586 nt1.14□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 RAD34YDR314C 2079 nt1.14□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 PAU12YGR294W 363 nt1.14□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 YIR044CYIR044C 186 nt1.14□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 RPL38YLR325C 237 nt1.14□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 BSC3YLR465C 309 nt1.14□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 PAU24YBR301W 363 nt1.14□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 CDC39YCR093W 6327 nt1.13□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 PAN2YGL094C 3348 nt1.12□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 MDS3YGL197W 4464 nt1.12□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 IFH1YLR223C 3258 nt1.12□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 GPG1YGL121C 381 nt1.12□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.12□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 NUP157YER105C 4176 nt1.12□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 RIM20YOR275C 1986 nt1.12□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 SLD3YGL113W 2007 nt1.11□□□□□ -2.23
SPE3Q12074 YHR138CYHR138C 345 nt1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms