Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt3.27□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 FLO1YAR050W 4614 nt3.27□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 NET1YJL076W 3570 nt3.27□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt3.27□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 TFC4YGR047C 3078 nt3.26□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 STB6YKL072W 2301 nt3.26□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 SIN3YOL004W 4611 nt3.26□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.26□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.26□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 RPS22AYJL190C 393 nt3.26□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt3.26□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 NOP14YDL148C 2433 nt3.25□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 VTC3YPL019C 2508 nt3.25□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt3.25□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 snR39BsnR39B 96 nt3.25□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 AUS1YOR011W 4185 nt3.25□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 PHO91YNR013C 2685 nt3.25□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 PSK1YAL017W 4071 nt3.24□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 CDC53YDL132W 2448 nt3.24□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 APL2YKL135C 2181 nt3.24□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 YDR521WYDR521W 336 nt3.23□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 POL2YNL262W 6669 nt3.23□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 SRO77YBL106C 3033 nt3.22□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 YEL025CYEL025C 3567 nt3.22□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 MMS22YLR320W 4365 nt3.22□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 LHS1YKL073W 2646 nt3.22□□□□□ -1.89
TFB4Q12004 SAP190YKR028W 3102 nt3.21□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 FIR1YER032W 2631 nt3.21□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 ALK1YGL021W 2283 nt3.21□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 NEW1YPL226W 3591 nt3.2□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 YSP2YDR326C 4317 nt3.2□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 DCP2YNL118C 2913 nt3.19□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 MLH1YMR167W 2310 nt3.19□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 SPO14YKR031C 5052 nt3.18□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 FLO5YHR211W 3228 nt3.18□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 MMS1YPR164W 4224 nt3.18□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 PKH1YDR490C 2301 nt3.18□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 PDR8YLR266C 2106 nt3.17□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 BUD4YJR092W 4344 nt3.17□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 MET6YER091C 2304 nt3.17□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 GCN1YGL195W 8019 nt3.17□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 APL1YJR005W 2103 nt3.16□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 SET3YKR029C 2256 nt3.16□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 NFT1YKR103W 3657 nt3.16□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 RPO41YFL036W 4056 nt3.16□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 YLL020CYLL020C 306 nt3.16□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 YGR067CYGR067C 2415 nt3.16□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 STU2YLR045C 2667 nt3.16□□□□□ -1.9
TFB4Q12004 ECM21YBL101C 3354 nt3.15□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt3.15□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt3.15□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 HMI1YOL095C 2121 nt3.15□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 CSR2YPR030W 3366 nt3.15□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt3.15□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 CBF2YGR140W 2871 nt3.14□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 FLO11YIR019C 4104 nt3.14□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 REC8YPR007C 2043 nt3.14□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt3.13□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 INP51YIL002C 2841 nt3.13□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 UTP8YGR128C 2142 nt3.13□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.13□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 UBP1YDL122W 2430 nt3.12□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 SNQ2YDR011W 4506 nt3.12□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 RPS21AYKR057W 264 nt3.11□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 UBP15YMR304W 3693 nt3.11□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 COG6YNL041C 2520 nt3.09□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt3.09□□□□□ -1.91
TFB4Q12004 DYN1YKR054C 12279 nt3.09□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 SAP185YJL098W 3177 nt3.08□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 BFR2YDR299W 1605 nt3.08□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 MBB1YJL199C 327 nt3.08□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 MAK10YEL053C 2202 nt3.08□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt3.07□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 MLH3YPL164C 2148 nt3.07□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 YPP1YGR198W 2454 nt3.07□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 CIN8YEL061C 3003 nt3.06□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 PKH2YOL100W 3246 nt3.06□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt3.06□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 DRS2YAL026C 4068 nt3.05□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 YNL266WYNL266W 420 nt3.05□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 RAX2YLR084C 3663 nt3.05□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 RGC1YPR115W 3252 nt3.05□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 JSN1YJR091C 3276 nt3.04□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 YPL150WYPL150W 2706 nt3.04□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 RPL37BYDR500C 267 nt3.04□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt3.04□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 BUB1YGR188C 3066 nt3.04□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 MSH5YDL154W 2706 nt3.03□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 MDS3YGL197W 4464 nt3.03□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt3.03□□□□□ -1.92
TFB4Q12004 SMC6YLR383W 3345 nt3.02□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 SSN2YDR443C 4263 nt3.02□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 EAF1YDR359C 2949 nt3.02□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 TAH1YCR060W 336 nt3.02□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 COG4YPR105C 2586 nt3.01□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt3.01□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 MDM1YML104C 3384 nt3.01□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 VPS8YAL002W 3825 nt3.01□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 ISW1YBR245C 3390 nt3□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 BIR1YJR089W 2865 nt3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.2 ms