Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 KAP120YPL125W 3099 nt0.75□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 PDE2YOR360C 1581 nt0.75□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 HUG1YML058W-A 207 nt0.75□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 RRT1YBL048W 312 nt0.75□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 ERP4YOR016C 624 nt0.75□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 RIM20YOR275C 1986 nt0.74□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 NPC2YDL046W 522 nt0.74□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 YDL158CYDL158C 309 nt0.74□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.74□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 YHR125WYHR125W 306 nt0.74□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 NFU1YKL040C 771 nt0.74□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 ALY2YJL084C 3141 nt0.74□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 SMC1YFL008W 3678 nt0.74□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 SCC2YDR180W 4482 nt0.74□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 YDL206WYDL206W 2289 nt0.73□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 SLI15YBR156C 2097 nt0.73□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 SLD3YGL113W 2007 nt0.73□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 YHR130CYHR130C 336 nt0.73□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 YOR199WYOR199W 330 nt0.73□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 NUP157YER105C 4176 nt0.73□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 ZIP2YGL249W 2115 nt0.72□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.72□□□□□ -2.29
NIP7Q08962 TIM13YGR181W 318 nt0.71□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 AIM29YKR074W 468 nt0.71□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 CDC33YOL139C 642 nt0.71□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YOR029WYOR029W 336 nt0.71□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YKL202WYKL202W 582 nt0.7□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.7□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YPR153WYPR153W 423 nt0.7□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YJR003CYJR003C 1560 nt0.7□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 IFH1YLR223C 3258 nt0.69□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 DOP1YDR141C 5097 nt0.69□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YBL071CYBL071C 309 nt0.69□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 WAR1YML076C 2835 nt0.68□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YNL122CYNL122C 348 nt0.68□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 ZEO1YOL109W 342 nt0.68□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 RPB10YOR210W 213 nt0.68□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 BI2Q0110 1272 nt0.67□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.67□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 snR54snR54 86 nt0.67□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YDL011CYDL011C 324 nt0.66□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YDL196WYDL196W 330 nt0.66□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 NHP2YDL208W 471 nt0.66□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 WIP1YDR374W-A 270 nt0.66□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YDR521WYDR521W 336 nt0.66□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YGR290WYGR290W 444 nt0.66□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YJL135WYJL135W 318 nt0.66□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YLR287CYLR287C 1068 nt0.66□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 CMC4YMR194C-B 222 nt0.66□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.66□□□□□ -2.3
NIP7Q08962 GPG1YGL121C 381 nt0.65□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.65□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 RPS30BYOR182C 192 nt0.65□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 YGR042WYGR042W 816 nt0.64□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 ECL1YGR146C 636 nt0.64□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.64□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 YLR171WYLR171W 390 nt0.64□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 DIE2YGR227W 1578 nt0.64□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 PAC1YOR269W 1485 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 ALG13YGL047W 609 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 YOL160WYOL160W 342 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 PKH2YOL100W 3246 nt0.63□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 PAN2YGL094C 3348 nt0.62□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 FYV7YLR068W 456 nt0.62□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.62□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 IES4YOR189W 351 nt0.62□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.62□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 UTP20YBL004W 7482 nt0.62□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 SEC1YDR164C 2175 nt0.62□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 GEA2YEL022W 4380 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 DBP6YNR038W 1890 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 snR72snR72 98 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 SWF1YDR126W 1011 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 INA22YIR024C 651 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 YPL229WYPL229W 621 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 YPL261CYPL261C 309 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 snR189snR189 189 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 LOA1YPR139C 903 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 snR51snR51 107 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 OST1YJL002C 1431 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 YMR160WYMR160W 2451 nt0.61□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 ISD11YER048W-A 285 nt0.6□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.59□□□□□ -2.31
NIP7Q08962 RAD34YDR314C 2079 nt0.59□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 RKR1YMR247C 4689 nt0.58□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 SDH7YDR511W 402 nt0.58□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.58□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 CBS1YDL069C 690 nt0.57□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.57□□□□□ -2.32
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