Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL16A1Q07092 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms