Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APBA1Q02410 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms