Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms