Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP2P81877 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms