Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1-1P60608 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms