Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLF3P57682 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLF3P57682 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms