Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP6P55212 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP6P55212 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP6P55212 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms