Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAP1L1P55209 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms