Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms