Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACAA2P42765 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms