Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPHP41219 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPHP41219 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPHP41219 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPHP41219 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPHP41219 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPHP41219 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPHP41219 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPHP41219 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPHP41219 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPHP41219 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPHP41219 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPHP41219 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPHP41219 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms