Protein–RNA interactions for Protein: P39981

AVT2, Vacuolar amino acid transporter 2, yeastyeast

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT2P39981 YGL239CYGL239C 315 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT2P39981 QCR9YGR183C 201 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YHR125WYHR125W 306 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT2P39981 SDH2YLL041C 801 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT2P39981 UBP3YER151C 2739 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT2P39981 IFH1YLR223C 3258 nt0.81□□□□□ -2.28
AVT2P39981 CYC7YEL039C 342 nt0.81□□□□□ -2.28
AVT2P39981 RPL9BYNL067W 576 nt0.81□□□□□ -2.28
AVT2P39981 ZEO1YOL109W 342 nt0.81□□□□□ -2.28
AVT2P39981 NUT2YPR168W 474 nt0.81□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT2P39981 HIT1YJR055W 495 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YLR171WYLR171W 390 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YBL071CYBL071C 309 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT2P39981 ATP19YOL077W-A 207 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT2P39981 PRP16YKR086W 3216 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT2P39981 SEC1YDR164C 2175 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT2P39981 PIG1YLR273C 1947 nt0.79□□□□□ -2.28
AVT2P39981 MRPL31YKL138C 396 nt0.79□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.79□□□□□ -2.28
AVT2P39981 snR54snR54 86 nt0.79□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YLL032CYLL032C 2478 nt0.79□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YDL073WYDL073W 2955 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT2P39981 NHP2YDL208W 471 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT2P39981 ECL1YGR146C 636 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YLR101CYLR101C 396 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YLR287CYLR287C 1068 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT2P39981 NUP157YER105C 4176 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YLL054CYLL054C 2532 nt0.78□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YCK3YER123W 1575 nt0.78□□□□□ -2.29
AVT2P39981 SPT21YMR179W 2277 nt0.77□□□□□ -2.29
AVT2P39981 RFX1YLR176C 2436 nt0.77□□□□□ -2.29
AVT2P39981 NUP145YGL092W 3954 nt0.77□□□□□ -2.29
AVT2P39981 SWI6YLR182W 2412 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT2P39981 SLD3YGL113W 2007 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT2P39981 NOC3YLR002C 1992 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT2P39981 SCW11YGL028C 1629 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT2P39981 CBS1YDL069C 690 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YDR114CYDR114C 303 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YDR269CYDR269C 324 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YDR521WYDR521W 336 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT2P39981 CMC4YMR194C-B 222 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT2P39981 ENV11YGR071C 2583 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YMR160WYMR160W 2451 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 TIM13YGR181W 318 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 RPS27AYKL156W 249 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YLR456WYLR456W 615 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 UBC7YMR022W 498 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 IRC23YOR044W 474 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YPL182CYPL182C 384 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 SAS3YBL052C 2496 nt0.75□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YHL041WYHL041W 450 nt0.74□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YIL059CYIL059C 366 nt0.74□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.74□□□□□ -2.29
AVT2P39981 MPT5YGL178W 2580 nt0.74□□□□□ -2.29
AVT2P39981 MYO1YHR023W 5787 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YDL011CYDL011C 324 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT2P39981 YJL135WYJL135W 318 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT2P39981 UPS1YLR193C 528 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT2P39981 FIG4YNL325C 2640 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT2P39981 UTP20YBL004W 7482 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT2P39981 EFR3YMR212C 2349 nt0.72□□□□□ -2.29
AVT2P39981 RPL26AYLR344W 384 nt0.72□□□□□ -2.29
AVT2P39981 RPB10YOR210W 213 nt0.72□□□□□ -2.29
AVT2P39981 SET3YKR029C 2256 nt0.72□□□□□ -2.29
AVT2P39981 DIE2YGR227W 1578 nt0.71□□□□□ -2.3
AVT2P39981 snR72snR72 98 nt0.71□□□□□ -2.3
AVT2P39981 YBR012CYBR012C 420 nt0.71□□□□□ -2.3
AVT2P39981 STO1YMR125W 2586 nt0.71□□□□□ -2.3
AVT2P39981 GEA2YEL022W 4380 nt0.7□□□□□ -2.3
AVT2P39981 PCF11YDR228C 1881 nt0.7□□□□□ -2.3
AVT2P39981 NPC2YDL046W 522 nt0.7□□□□□ -2.3
AVT2P39981 YAP6YDR259C 1152 nt0.7□□□□□ -2.3
AVT2P39981 RRT1YBL048W 312 nt0.7□□□□□ -2.3
AVT2P39981 LCD1YDR499W 2244 nt0.7□□□□□ -2.3
AVT2P39981 SDH7YDR511W 402 nt0.69□□□□□ -2.3
AVT2P39981 ZIP2YGL249W 2115 nt0.69□□□□□ -2.3
AVT2P39981 YKL083WYKL083W 615 nt0.69□□□□□ -2.3
AVT2P39981 YAR047CYAR047C 321 nt0.69□□□□□ -2.3
AVT2P39981 YOL014WYOL014W 375 nt0.69□□□□□ -2.3
AVT2P39981 snR51snR51 107 nt0.69□□□□□ -2.3
AVT2P39981 AIM9YER080W 1884 nt0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1165.3 ms