Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA6P31267 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms