Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMOD1P29536 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMOD1P29536 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms