Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDSP20132 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDSP20132 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDSP20132 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDSP20132 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDSP20132 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms