Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN1P18031 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN1P18031 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN1P18031 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN1P18031 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN1P18031 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN1P18031 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN1P18031 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms