Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD1P17405 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms